前身是广西省立医学院。1940年校址迁至桂林。1949年以前，学校在战乱中七次迁徙校址，三次变更校名。1949年11月更名为广西省医学院。1952年由中央卫生部委托中南卫生部直接领导。1953年4月中央卫生部批准改称为广西医学院。1954年7月由桂林迁回南宁市现址至今。1996年5月教育部批准更名为广西医科大学。
学校是全国建校较早的22所医学院校之一，是全国最早定点招收外国留学生、港澳台学生和华侨学生的8所医学院校之一，是教育部批准的有招收本科临床医学专业（英语授课）留学生资格的首批30所高校之一，是广西政府重点建设的大学之一，是广西医学教育、医学研究、临床医疗和预防保健的中心。
师资力量
学校有专任教师1586名，其中具有研究生学位及以上教师1300人，正高职称479名，副高职称506名，高级职称教师占62%，国家“万人计划”科技创新领军人才1名，“新世纪百千万人才工程”国家级人选4名，国家有突出贡献的中青年专家8名，教育部新世纪优秀人才支持计划入选者8名，广西首批院士后备人选1名，“八桂学者”7名、广西“特聘专家”7名，享受国务院政府特殊津贴专家75名，全国优秀科技工作者5名，以及一批选聘任中华医学会专业学会常委、委员和广西医学会各专业学会主任委员、中华医学会系列杂志编委近100名，还有一批优秀人才被选为国家级和省级高校中青年学科带头人等人才工程重点培养对象。
“新世纪百千万人才工程”国家级人选（4名）：施焕中、高枫、赵永祥、张健
国家有突出贡献的中青年专家（8名）：黎乐群、熊君福、王植柔、唐步坚、何巍、施焕中、李力、张健
院系概况
截至2021年12月，学校设有1个研究生院和19个学院（即：基础医学院、公共卫生学院、护理学院、药学院、国际教育学院、高等职业技术学院、人文社会科学学院、马克思主义学院、外国语学院、全科医学院、信息与管理学院、生命科学研究院、继续教育学院、体育与健康学院、第一临床医学院、第二临床医学院、肿瘤医学院、口腔医学院、武鸣临床医学院），有本科专业30个，高职高专专业（方向）6个。
教学建设
截至2014年4月，学校有国家级特色专业建设点5个，国家级人才培养模式创新实验区2个，省级实验教学示范中心4个；国家级精品课程1个，省级精品课程29个；国家级教学团队1个，省级教学团队7个；获国家级教学成果奖二等奖1项，国家级质量工程项目15项。
国家级特色专业建设点（5个）：临床医学（含肿瘤学、麻醉学、医学影像学方向）、预防医学、口腔医学、药学、护理学
国家级人才培养模式创新实验区（2个）：口腔医学、预防医学
国家级精品课程（1个）：组织学与胚胎学
省级精品课程（29个）：妇产科学、卫生统计学、妇科肿瘤学、医用物理学、口腔内科学、耳鼻喉科学、口腔颌面外科学、环境卫生学、组织学与胚胎学、人体解剖学、临床检验基础、眼科学、医学影像诊断学、微生物学、医学免疫学、人体寄生虫学、诊断学、外科学总论、生物化学、实验生理科学、生理学、儿科学、病理学、外科学各论、职业卫生与职业医学、药理学、内科学、营养与食品卫生学、思想道德修养与法律基础。
学科建设
截至2021年12月，学校有一级学科博士学位授权点5个和一级学科硕士学位授权点10个、临床医学博士专业学位授权点1个、口腔医学博士专业学位授权点1个、硕士专业学位授权点6个、博士后科研流动站4个。有国家重点（培育）学科1个、国家临床重点专科11个、国家中医药管理局重点专科2个、广西一流学科5个、广西一流培育学科1个、广西特色优势重点学科6个、广西重点学科9个和广西临床重点专科37个（含建设项目）。
博士后科研流动站（4个）：基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学
ESI世界排名前1%学科：临床医学、生物与生物化学学科、药理学与毒理学
国家重点（培育）学科（1个）：肿瘤学
省级重点学科（10个）：儿科学、肿瘤学、外科学、内科学、耳鼻咽喉科学、药理学、人体解剖与组织胚胎学、口腔颌面外科学、病理学与病理生理学、流行病与卫生统计学
省级一流学科（5个）：临床医学、基础医学、公共卫生与预防医学、药理学、口腔医学
省级一流（培育）学科（1个）：生物医学工程
一级学科博士学位授权点（5个）：基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、口腔医学、药学
博士专业学位授权点（2个）：临床医学、口腔医学
一级学科硕士学位授权点（10个）：生物医学工程、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、护理学、口腔医学、公共管理学、生物学、药学
硕士专业学位授权点（6个）：临床医学、口腔医学、公共卫生、护理、药学、社会工作
合作交流
截至2017年3月，学校先后派出优秀教师和科研人员4000多人次到美国、英国、法国、德国、丹麦、瑞典、日本、韩国、澳大利亚、越南、泰国等50多个国家和地区的大学、医院、医疗或研究机构、学术机构讲学、留学、进修、攻读学位及开展国际学术交流，并建立了稳定的学术交流渠道和合作关系。接待40多个国家和地区的专家学者来校访问、讲学、交流与科研合作6000多人次。
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