安徽农业大学的前身是源自省立安徽大学的，1954年，国立安徽大学农学院独立，从芜湖搬迁到合肥，成立安徽农学院。1966年，停止办学，1968年搬迁到宿县，下设滁县、凤阳两个分院。1976年，重新恢复开始办学。1978年，重新搬迁回合肥。1981年，安徽农学院被国务院批准为全国首批硕士学位授权单位。1995年，更名为安徽农业大学。1998年，被国务院学位委员会批准为博士学位授权单位。2011年，农业部与安徽省人民政府共建安徽农业大学，安徽农业大学成为安徽省第一所省部共建的省属高校。2012年，经教育部和科技部批准，安徽农业大学成为国家首批建设“新农村发展研究院”的十所高校之一。2014年，安徽省人民政府和国家林业局共建安徽农业大学。
目前拥有19个二级学院，共计80个本科专业，现有8个一级学科博士学位授权点、17个一级学科硕士学位授权点、8个硕士专业学位授权点。
一级硕士点：生物学、化学、生态学、机械工程、计算机科学与技术、公共管理、应用经济学、工商管理、大气科学、城乡规划学、食品科学与工程、环境科学与工程、作物学、园艺学、农业资源利用、植物保护学、畜牧学、水产、兽医学、林学、农林经济管理、风景园林学、草学
国家级特色专业：茶学、植物保护、农业机械化及其自动化，动物医学，木材材料与科学，省级重点专业：农业建筑环境与能源工程、农林经济管理、生态学、园林、水产养殖学、生物技术、生物科学、设施农业科学与工程、食品质量与安全、社会工作、艺术设计、信息与计算科学
在职教职工1867人，其中教授、副教授等高级专业技术职务752人，博士生、硕士生导师889人，现有双聘院士1人。
学科评估中，生物学B，生态学、园艺学B-，作物学、植物保护C+，畜牧学、林学C，食品科学与工程、风景园林学、农业资源与环境C-。
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