学院目前拥有应用经济学、管理科学与工程、工商管理三个一级学科硕士授权点以及政治经济学二级硕士授权点，其中应用经济学为重庆市“十二五”、“十三五”市级重点学科，管理科学与工程为校级重点建设学科。应用经济学下设区域经济学、金融学、产业经济学、劳动经济学、数量经济学五个学科专业，管理科学与工程下设管理科学与管理工程两个学科专业，工商管理下设会计学、企业管理、技术经济及管理三个学科专业。拥有职业教育硕士、农业硕士和工商管理（MBA）三个专业硕士点。
经济与管理学院2020年硕士研究生招生调剂涉及区域经济学、金融学、产业经济学、劳动经济学、数量经济学、管理工程、管理科学、会计学、企业管理、技术经济及管理等学术型硕士专业以及工商管理硕士专业（MBA），其中MBA包括全日制和非全日制。
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