1951年为解决川藏公路急需的技术人才，西南军委在重庆南岸区七公里设立西南交通专科学校。1952年更名为西南交通学校；1953年更名为重庆公路学校；1954年，学校划归交通部管理，更名为交通部西南公路学校；1955年更名为交通部重庆公路工程学校；1958年更名为四川省重庆公路工程学校。1960年8月成都工学院土木系、武汉水运学院水工系、四川冶金学院冶金系迁入四川省重庆公路工程学校，组建重庆交通学院。1971年至1979年期间学校撤销，并入重庆建筑工程学院。1979年恢复独立办学。在以后的发展中，陆续有交通部西南水运工程科学研究院、重庆河运校并入。
学校现有交通运输工程、水利工程、管理科学与工程、土木工程4个一级学科博士学位授权点，16个二级学科博士学位授权点，土木工程、交通运输工程、水利工程3个博士后科研流动站，土木工程等18个一级学科硕士学位授权点，土木水利等13个硕士专业学位授权类别。学校是重庆有推免权的8所院校之一，保研率为3.2%，每个班前一两名才有机会保研。
二、优势
从重庆交通大学的发展历程可以看出，其优势为公路交通、水利相关、公路土木建设。国家特色专业有水利工程、交通运输工程、土木工程。
地区
专业
选科
分数/位次2022
重庆
土木类（包含专业：土木工程、道路桥梁与渡河工程）（科学城校区1）
物理
515/35260
重庆
水利类（包含专业：水利水电工程、港口航道与海岸工程）（科学城校区1）
物理
508/38616
重庆
交通运输类（包含专业：交通运输、交通工程、交通设备与控制工程）（科学城校区1）
物理
522/32073
四川
交通运输类（包含专业：交通运输、交通工程、交通设备与控制工程）（科学城校区1）
理科
557/45585
四川
土木类（包含专业：土木工程、道路桥梁与渡河工程）（科学城校区1）
理科
547/53515
四川
水利类（包含专业：水利水电工程、港口航道与海岸工程）（科学城校区1）
理科
542/57673
三、其他优势及中外合作
重庆交通大学是西南地区唯一开设有轮机工程、航海技术、船舶电子电气工程的学校，对于低分毕业后又想找份好工作的男生是不错的选择，缺点就是长期在海上出差。
地区
专业
选科
分数/位次2022
备注
重庆
轮机工程、航海技术、船舶电子电气工程
物理
476/54758
提前批A段，最低分
重庆
机械类（包含专业：机械设计制造及其自动化、材料成型及控制工程、机械电子工程、车辆工程）（科学城校区1）
物理
512/36711
重庆
机械设计制造及其自动化（（中外合作办学）合作院校：英国诺森比亚大学外方学费按当年外方学校收费标准执行）（科学城校区1）
物理
493/46109
“3+1”or“4+0”
四川
轮机工程、航海技术、船舶电子电气工程
理科
496/103527
提前批
四川
机械类（包含专业：机械设计制造及其自动化、材料成型及控制工程、机械电子工程、车辆工程）（科学城校区1）
理科
542/57673
四川
机械设计制造及其自动化（中外合作办学）（科学城校区1，专业备注：合作院校：英国诺森比亚大学。外方学费按当年外方学校收费标准执行）（中外合作办学）
理科
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